La empresa fue creada en 1979, siendo ministro de Agricultura, Germán Bula Hoyos, con el fin de consolidar un mercado de físicos, luego de la desaparición del Instituto de Mercadeo Agropecuario (Idema), entidad que dejaría de comprar las cosechas e imponer precios.
Posteriormente, la BNA entró en el negocio de los contratos de futuros, como ha sucedido en otras bolsas, tal es el caso de la bolsa de granos de Chicago, hoy, el mayor mercado de opciones y de futuros del mundo. Los negocios de la BNA seguirán siendo los mismos.
