Desde el 2006 PROEXPORT viene realizando un trabajo conjunto con agremiaciones como la Asociación de Líneas Aéreas Internacionales de Colombia, Alaico; la Asociación de Transporte Aéreo de Colombia, ATAC; y la Federación Colombiana de Transitarios Intermediarios Aduaneros, y Almacenadotes, Fitac, con el fin de lograr que los procesos de inspección de mercancías en los aeropuertos sea más fáciles y concertados.